77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1532 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  37.38 
 
 
1210 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  37.25 
 
 
1210 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1264 aa  2593    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  96.99 
 
 
1264 aa  2504    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.37 
 
 
1220 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.25 
 
 
1210 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  99.92 
 
 
1264 aa  2591    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  86.1 
 
 
1262 aa  2191    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  45.71 
 
 
963 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  43.18 
 
 
1422 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  38.45 
 
 
1209 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  37.33 
 
 
1210 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  98.18 
 
 
1264 aa  2553    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  37.38 
 
 
1210 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  37.39 
 
 
1130 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  37.05 
 
 
1216 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  44.25 
 
 
1329 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  36.77 
 
 
1127 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  40.94 
 
 
1297 aa  426  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  35.28 
 
 
1104 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  34.96 
 
 
1116 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  39.27 
 
 
1314 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40 
 
 
1083 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.98 
 
 
1291 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  38.5 
 
 
1012 aa  357  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  36.63 
 
 
1099 aa  348  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  34.99 
 
 
1125 aa  348  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.76 
 
 
1086 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  33.12 
 
 
1086 aa  323  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.7 
 
 
1001 aa  316  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.6 
 
 
1055 aa  297  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  35.6 
 
 
1178 aa  276  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  33.81 
 
 
988 aa  226  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  27.51 
 
 
1137 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.74 
 
 
1139 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.97 
 
 
1139 aa  171  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.51 
 
 
1139 aa  168  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  28.86 
 
 
1146 aa  165  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  25.39 
 
 
1139 aa  161  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.45 
 
 
1108 aa  145  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.83 
 
 
1275 aa  138  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  30 
 
 
971 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  28.06 
 
 
1249 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  44.72 
 
 
194 aa  124  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.36 
 
 
1094 aa  109  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  23.29 
 
 
465 aa  101  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  51.76 
 
 
1440 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  17.93 
 
 
903 aa  82  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.6 
 
 
898 aa  75.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  23.92 
 
 
789 aa  75.5  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  55.56 
 
 
1822 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  47.14 
 
 
244 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  47.14 
 
 
244 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.21 
 
 
754 aa  69.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  47.06 
 
 
244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  47.06 
 
 
244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.09 
 
 
852 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  49.15 
 
 
251 aa  63.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.3 
 
 
774 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  39.39 
 
 
1838 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.13 
 
 
762 aa  61.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  26.97 
 
 
739 aa  60.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  43.75 
 
 
146 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.9 
 
 
837 aa  58.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  38.03 
 
 
1088 aa  58.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  35.29 
 
 
1822 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
1030 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  24.18 
 
 
670 aa  55.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.09 
 
 
811 aa  54.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  23.24 
 
 
817 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  21.96 
 
 
634 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  40.91 
 
 
113 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  26.27 
 
 
263 aa  45.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  37.04 
 
 
475 aa  45.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>