79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0928 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1210 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1210 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  38.64 
 
 		 1209 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  46.46 
 
 		 963 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  100 
 
 		 1262 aa  2597    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.34 
 
 		 1220 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  86.1 
 
 		 1264 aa  2196    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  37.49 
 
 		 1210 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  86.49 
 
 		 1264 aa  2224    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.49 
 
 		 1210 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  86.02 
 
 		 1264 aa  2194    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  41.66 
 
 		 1422 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  86.26 
 
 		 1264 aa  2203    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  37.71 
 
 		 1210 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  36.79 
 
 		 1216 aa  496  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  36.4 
 
 		 1130 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.63 
 
 		 1329 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  36.78 
 
 		 1127 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  46.5 
 
 		 1297 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1104 aa  406  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40.32 
 
 		 1314 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1116 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  41.75 
 
 		 1083 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  31.51 
 
 		 1125 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1012 aa  359  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  38.1 
 
 		 1099 aa  357  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  39.83 
 
 		 1291 aa  353  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  36.29 
 
 		 1086 aa  334  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1001 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  33.38 
 
 		 1086 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1055 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1178 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  35.91 
 
 		 988 aa  230  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  31.07 
 
 		 1137 aa  180  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.31 
 
 		 1139 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  30.92 
 
 		 1139 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  28.28 
 
 		 1146 aa  167  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1139 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1108 aa  145  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1275 aa  138  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1249 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.56 
 
 		 971 aa  131  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  55.4 
 
 		 194 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.95 
 
 		 1094 aa  107  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  23.22 
 
 		 465 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  61.29 
 
 		 1440 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.28 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  24.1 
 
 		 898 aa  75.5  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.89 
 
 		 789 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  22.36 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  54.69 
 
 		 1822 aa  70.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  45.83 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  45.83 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  47.06 
 
 		 244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  47.06 
 
 		 244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  50 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.44 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  20.63 
 
 		 762 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  45.31 
 
 		 146 aa  63.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  42.42 
 
 		 1838 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.09 
 
 		 774 aa  62  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.3 
 
 		 837 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1822 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  32.43 
 
 		 1030 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  38.03 
 
 		 1088 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  26.4 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.06 
 
 		 857 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.86 
 
 		 800 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.09 
 
 		 811 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  23.24 
 
 		 817 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.43 
 
 		 634 aa  55.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  22.71 
 
 		 670 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30.11 
 
 		 182 aa  51.6  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  33.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  26.27 
 
 		 263 aa  46.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  37.88 
 
 		 113 aa  46.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  30.12 
 
 		 475 aa  45.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>