79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02045 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  37.22 
 
 
1210 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  37.22 
 
 
1210 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  38.28 
 
 
1209 aa  708    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  45.5 
 
 
963 aa  786    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  86.26 
 
 
1262 aa  2196    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.21 
 
 
1220 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  98.18 
 
 
1264 aa  2553    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  37.08 
 
 
1210 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  97.31 
 
 
1264 aa  2512    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.08 
 
 
1210 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  98.1 
 
 
1264 aa  2551    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  43.35 
 
 
1422 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  100 
 
 
1264 aa  2598    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  37.16 
 
 
1210 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  36.9 
 
 
1130 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  36.8 
 
 
1216 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.78 
 
 
1329 aa  479  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  36.51 
 
 
1127 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  41.32 
 
 
1297 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  34.77 
 
 
1116 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  35.02 
 
 
1104 aa  406  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  38.78 
 
 
1314 aa  393  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40.16 
 
 
1083 aa  387  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  39.3 
 
 
1291 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  38.5 
 
 
1012 aa  358  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  35.2 
 
 
1125 aa  355  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  36.79 
 
 
1099 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.76 
 
 
1086 aa  335  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.77 
 
 
1086 aa  325  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.5 
 
 
1001 aa  323  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.25 
 
 
1055 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  35.16 
 
 
1178 aa  271  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  35.68 
 
 
988 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  31.82 
 
 
1137 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.35 
 
 
1139 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  26.56 
 
 
1139 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  30.06 
 
 
1139 aa  166  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.23 
 
 
1139 aa  162  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.7 
 
 
1146 aa  158  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  22.31 
 
 
1108 aa  148  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.7 
 
 
971 aa  135  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.3 
 
 
1275 aa  135  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  26.87 
 
 
1249 aa  129  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  44.72 
 
 
194 aa  124  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  24.9 
 
 
1094 aa  108  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  22.07 
 
 
465 aa  98.6  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.7 
 
 
903 aa  84  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  51.76 
 
 
1440 aa  82  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  24.88 
 
 
789 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.69 
 
 
898 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  55.56 
 
 
1822 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  47.14 
 
 
244 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  47.14 
 
 
244 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.94 
 
 
754 aa  68.6  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  47.06 
 
 
244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  47.06 
 
 
244 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.13 
 
 
762 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  49.15 
 
 
251 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  23.95 
 
 
774 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  39.39 
 
 
1838 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.1 
 
 
852 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.91 
 
 
837 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  43.75 
 
 
146 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.34 
 
 
857 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  38.03 
 
 
1088 aa  58.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.78 
 
 
800 aa  58.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.43 
 
 
811 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  35.29 
 
 
1822 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
1030 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  23.59 
 
 
817 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  23.81 
 
 
670 aa  55.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  25.82 
 
 
739 aa  52.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  21.13 
 
 
634 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  49.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  40.91 
 
 
113 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  37.04 
 
 
475 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  26.27 
 
 
263 aa  45.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>