225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1237 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 312 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  57.61 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  39.63 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  36.42 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  37.65 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  29.45 
 
 		 292 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  25.82 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  26.96 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 272 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  24.01 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  34.11 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  23.3 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.25 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  25.72 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  22.65 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  24.89 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.27 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25.09 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.67 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  24.8 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  24.7 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  30.2 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  24.91 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.57 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  31.2 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.53 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  24.91 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  31.3 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.92 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  25.19 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  35.29 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  28.19 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  28.39 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  33.63 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  33.04 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  29.25 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  30.48 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  29.69 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  29.69 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  29.69 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  24.31 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  29.2 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  29.69 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  28.35 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  28.35 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.48 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  30.17 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.6 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.66 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.66 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  33.64 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  33.64 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  30.51 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  28.77 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  29.31 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  23.76 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  27.61 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  27.97 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  27.92 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  27.85 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>