150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0730 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  100 
 
 
570 aa  1135    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  37.07 
 
 
614 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  39.52 
 
 
605 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  37.6 
 
 
598 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  35.87 
 
 
821 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  36.04 
 
 
592 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  34.11 
 
 
610 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.77 
 
 
608 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  35.87 
 
 
592 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  35.53 
 
 
592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.82 
 
 
612 aa  325  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  37.48 
 
 
581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  32.5 
 
 
635 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  33.28 
 
 
611 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  29.98 
 
 
618 aa  310  5e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  32.32 
 
 
627 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  31.51 
 
 
638 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  34.56 
 
 
606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  34.04 
 
 
657 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  32.4 
 
 
642 aa  296  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  30.96 
 
 
616 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  34.24 
 
 
558 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.61 
 
 
635 aa  286  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.33 
 
 
539 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  30.31 
 
 
615 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.54 
 
 
647 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.48 
 
 
612 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  30.68 
 
 
612 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  30.35 
 
 
622 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  30.05 
 
 
644 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  29.49 
 
 
647 aa  266  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  29.22 
 
 
640 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  28.41 
 
 
640 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
640 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
640 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  28.57 
 
 
683 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  28.41 
 
 
650 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.71 
 
 
694 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  28.16 
 
 
652 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  28.53 
 
 
673 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  28.36 
 
 
673 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  28.94 
 
 
673 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  28.02 
 
 
690 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  27.95 
 
 
630 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  35.45 
 
 
535 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  30.42 
 
 
627 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  28.48 
 
 
615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  32.83 
 
 
529 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  32.61 
 
 
537 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  27.3 
 
 
679 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 
521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  34.39 
 
 
512 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  31.9 
 
 
426 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.23 
 
 
538 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  33.66 
 
 
416 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.76 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  31.98 
 
 
427 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.44 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  28.1 
 
 
549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  33 
 
 
417 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  31.94 
 
 
410 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.75 
 
 
555 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.24 
 
 
685 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.6 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  25.44 
 
 
534 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  26.29 
 
 
499 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.29 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.67 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.67 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.17 
 
 
535 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  26.19 
 
 
539 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.2 
 
 
554 aa  104  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  23.87 
 
 
514 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.16 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.53 
 
 
639 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.36 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.16 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.22 
 
 
408 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.67 
 
 
407 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.67 
 
 
407 aa  63.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.07 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.56 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  38.46 
 
 
369 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.4 
 
 
411 aa  62  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.16 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.23 
 
 
412 aa  60.8  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.94 
 
 
410 aa  60.8  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.71 
 
 
411 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 
407 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.44 
 
 
407 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35 
 
 
408 aa  57.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.3 
 
 
431 aa  57.4  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  31.87 
 
 
434 aa  57.4  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  39.29 
 
 
356 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  31.13 
 
 
221 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  32 
 
 
205 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  35.05 
 
 
236 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  30.14 
 
 
106 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  38.16 
 
 
360 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>