59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4246 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  33.18 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  26.76 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0683  Phage related protein  30.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0620  Phage related protein  30.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  24.62 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  50.98 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 1086 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 309 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  51.02 
 
 		 1079 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 1051 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  39.06 
 
 		 389 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  46.88 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  40.24 
 
 		 97 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  42 
 
 		 3151 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 339 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2211  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.06 
 
 		 500 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00497018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  42.67 
 
 		 428 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1090 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 546 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  47.92 
 
 		 1082 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0628  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 302 aa  45.1  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  35.71 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  46.94 
 
 		 677 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  36.9 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 1091 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.9 
 
 		 913 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  39.66 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1442  hypothetical protein  24.21 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1309 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  24.41 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  38.24 
 
 		 531 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 440 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 651 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  35.71 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  42.59 
 
 		 935 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  42.11 
 
 		 404 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  42.11 
 
 		 404 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  37.35 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 552 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  38.6 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  21.76 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.66 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  48.15 
 
 		 638 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  29.31 
 
 		 295 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  40.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0950  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 166 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 		 1910 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>