237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4220 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  948    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.06 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  40.57 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  46.58 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  42.17 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.5 
 
 		 491 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  43.98 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  43.98 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.65 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  41.15 
 
 		 506 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.56 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  40.52 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.54 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.59 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.59 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.59 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.59 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.38 
 
 		 506 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.24 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.16 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  41.78 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  37.23 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.78 
 
 		 506 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  38.46 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  39.84 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.59 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  36.63 
 
 		 508 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.59 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  40.7 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  40.7 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  39.88 
 
 		 658 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  39.87 
 
 		 658 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  37.65 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37.11 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  36.38 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.6 
 
 		 536 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.53 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  36.99 
 
 		 508 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  35.73 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.31 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.31 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.11 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.6 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  36.92 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.11 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35.74 
 
 		 500 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.11 
 
 		 504 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  39.6 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.48 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  36.68 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  36.38 
 
 		 504 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  37.4 
 
 		 506 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  37.58 
 
 		 509 aa  289  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  35.5 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.07 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  34.84 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  38.79 
 
 		 505 aa  287  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  36.99 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  38.15 
 
 		 502 aa  285  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  36.17 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  41.07 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  35.35 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  36.87 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  38.19 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  36.27 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.84 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  35.28 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.91 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.08 
 
 		 514 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  36.87 
 
 		 508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  37.01 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  38.01 
 
 		 490 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.52 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  35.41 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  37.1 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  34.88 
 
 		 504 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  35.09 
 
 		 504 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  35.43 
 
 		 503 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  37.34 
 
 		 510 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  37.76 
 
 		 510 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  34.88 
 
 		 504 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  38.56 
 
 		 502 aa  282  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  36.29 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.56 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  37 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  35.42 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  36.7 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  38.64 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  39.74 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.9 
 
 		 516 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  34.88 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  36.51 
 
 		 502 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  36.31 
 
 		 506 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.17 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.33 
 
 		 500 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  34.53 
 
 		 500 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 		 501 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  36.98 
 
 		 499 aa  280  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>