More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2482 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.61 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  44.08 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  56.85 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.98 
 
 		 237 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  32.98 
 
 		 237 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.28 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  31.23 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.58 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.83 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.07 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.66 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  34.87 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  34.87 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  31.97 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  32.17 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  33.92 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  30.62 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  28.82 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.23 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  32.79 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.62 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  28 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  28.06 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.92 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  28.4 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.27 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  30.95 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  27.37 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  27.37 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 239 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  27.97 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.91 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  27.97 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  28.83 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  27.9 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  27.62 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  27.62 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  27.62 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  27.62 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.49 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.1 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.39 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.71 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  27.27 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.46 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.32 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.81 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.2 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.18 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.09 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  26.57 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  25.45 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  24.36 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  24.36 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.36 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  24.73 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  24.73 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.26 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  26.98 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  28.68 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  28 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.04 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  23.26 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.3 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  27.78 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  28.82 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  24.73 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.1 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.78 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  22.78 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>