More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3057 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 588 aa  1207    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  64.03 
 
 		 624 aa  806    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  52.54 
 
 		 614 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  50.43 
 
 		 613 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  48.57 
 
 		 615 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  47.8 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  47.67 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  48.34 
 
 		 685 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  45.64 
 
 		 613 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  49.58 
 
 		 622 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  46.21 
 
 		 620 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  46.04 
 
 		 620 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  46.63 
 
 		 653 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  46.37 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  45.99 
 
 		 641 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  44.16 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  45.96 
 
 		 613 aa  512  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  43.17 
 
 		 601 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  42.54 
 
 		 669 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 619 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  42.33 
 
 		 665 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  42.44 
 
 		 604 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 656 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.82 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  41.54 
 
 		 666 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 658 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  42.64 
 
 		 594 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  43.42 
 
 		 615 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  42.45 
 
 		 612 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  42.47 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  39.5 
 
 		 677 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.22 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 594 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 675 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  42.16 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.48 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.3 
 
 		 708 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  41.75 
 
 		 626 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  41.82 
 
 		 594 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 627 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  41.15 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  41.28 
 
 		 616 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  41.99 
 
 		 689 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 613 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  41.62 
 
 		 596 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 638 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 641 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  41.43 
 
 		 617 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 		 631 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  40.5 
 
 		 616 aa  439  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  41.42 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.82 
 
 		 613 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 		 616 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  40.77 
 
 		 622 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  40.93 
 
 		 624 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 		 636 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 646 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 660 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  39.63 
 
 		 617 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 665 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  39.2 
 
 		 649 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 		 678 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  39.58 
 
 		 678 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  41.65 
 
 		 591 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 640 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 608 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  40.89 
 
 		 593 aa  429  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 628 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.08 
 
 		 609 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 625 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  39.11 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 643 aa  425  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  39.83 
 
 		 649 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.77 
 
 		 623 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  39.7 
 
 		 684 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  39.76 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.77 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.76 
 
 		 607 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  41.34 
 
 		 590 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>