More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2101 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 209 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  41.85 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  40.54 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  38.59 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  37.89 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.78 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  35.87 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  35.33 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  34.62 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  34.52 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  37.11 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  32.79 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  34.38 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  32.98 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  32.98 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  33.51 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  29.69 
 
 		 302 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  33.86 
 
 		 305 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  30.81 
 
 		 308 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  31.61 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  29.82 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  39.5 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  27.69 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  27.69 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  38.66 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  29.23 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  29.23 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  29 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  29.17 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  31.03 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  27.14 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  29.95 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  29.48 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  29.83 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  29.89 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  29.31 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  26.42 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  28.87 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  23.37 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  28.33 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  30.06 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  24.16 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  27.72 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  28.87 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  27.64 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  27.12 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  27.11 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  30.51 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  28.57 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  29.23 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  24.53 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  26.46 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  26.67 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  26.55 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  28.24 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  29.07 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  26.87 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  27.22 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  28.65 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  28.65 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  28.49 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  28.25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  28.65 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  25.29 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  25.12 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  25.82 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0535  superoxide dismutase  34.48 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.478108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  28.27 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  31.45 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  28.36 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  30.06 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1545  superoxide dismutase, Fe-Mn  28.82 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  26.82 
 
 		 437 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0493  superoxide dismutase, Fe  33.62 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  25.48 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  28.42 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  26.59 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  32.54 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  29.89 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  26.67 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  27.5 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01314  superoxide dismutase  32.21 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.241762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  26.38 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  27.91 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  26.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  27.81 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  26.67 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  26.82 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  27.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>