More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2298 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  49.11 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  48.21 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.83 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  44.35 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.22 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  44.74 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  38.26 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  46.72 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  44.17 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.8 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  43.33 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  45.54 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.79 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.44 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  49.45 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  49.45 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  37.72 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  43.24 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  41.38 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.07 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.72 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.17 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  42.59 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  36.7 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43.14 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  38.66 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.88 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  40.68 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.54 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  41.8 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.45 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.45 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  38.26 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.52 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  43.62 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.19 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  40.68 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.9 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.07 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  44.07 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.65 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.34 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  42.42 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  36.61 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  38.39 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.28 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  38.66 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  34.95 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  34.48 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.72 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  36.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  38.39 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  35.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  38.74 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  35.19 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.75 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.9 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  38.39 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  38.39 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  44 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.23 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>