More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2177 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
259 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
259 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
259 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 
264 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  41.39 
 
 
261 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
259 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.69 
 
 
661 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
266 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
275 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
252 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
255 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
261 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
260 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
255 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
269 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
270 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.52 
 
 
257 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.46 
 
 
662 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
270 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
257 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
268 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
258 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2162  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
258 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308947  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
275 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.87 
 
 
659 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  37.74 
 
 
260 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
255 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
258 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
255 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
255 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
256 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
268 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.82 
 
 
662 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.06 
 
 
662 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.82 
 
 
663 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
262 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
275 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
258 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.1 
 
 
651 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
261 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
264 aa  138  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
261 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
266 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
263 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
258 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
266 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
269 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
266 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
266 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
249 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
272 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
249 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
272 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
249 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
261 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
264 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
264 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  34.5 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
264 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>