More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_320 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  98.8 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  97.01 
 
 		 167 aa  328  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  50 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  49.48 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  48.19 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  50 
 
 		 199 aa  179  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.64 
 
 		 216 aa  177  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  48.47 
 
 		 216 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 198 aa  177  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 215 aa  176  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  45.41 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  46.39 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 219 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 219 aa  170  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  46.39 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  46.15 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  47.45 
 
 		 286 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 250 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  44.33 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 249 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  46.43 
 
 		 219 aa  167  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  44.85 
 
 		 218 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  54.82 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  50 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  43.59 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  42.35 
 
 		 216 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.67 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  45.41 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.64 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  49.43 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  49.43 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 216 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 214 aa  156  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 219 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  42.35 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.51 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  45.14 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  44.27 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  45.03 
 
 		 196 aa  153  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 215 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  44.39 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  39.9 
 
 		 221 aa  151  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  42.35 
 
 		 218 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 217 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 218 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  40.1 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  40.1 
 
 		 218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  40.61 
 
 		 220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  43.09 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 218 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.4 
 
 		 313 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  37.76 
 
 		 218 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  44.1 
 
 		 314 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  40.82 
 
 		 440 aa  137  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  40.4 
 
 		 259 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  38.78 
 
 		 200 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.89 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.92 
 
 		 311 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40.12 
 
 		 312 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  40.96 
 
 		 286 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 273 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.72 
 
 		 292 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.5 
 
 		 276 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  43.03 
 
 		 304 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 293 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.04 
 
 		 310 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  40.74 
 
 		 278 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 294 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  40 
 
 		 290 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 293 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  38.04 
 
 		 291 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  41.72 
 
 		 296 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 294 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  41.21 
 
 		 302 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>