More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3982 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  810    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  26.07 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  26.07 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.88 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  25.72 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  26.02 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  23.81 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.44 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  23.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  23.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  24.32 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  24.32 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  24.55 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  24.32 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.57 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  24.32 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  24.32 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  26.13 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  22.89 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.13 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.13 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  24.91 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  23.96 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  22.73 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.36 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  20.22 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.29 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  22.35 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.29 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.29 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  23.55 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>