173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3864 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.06 
 
 
225 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.66 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  38.34 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  38.66 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  38.34 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  36.79 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  38.34 
 
 
192 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  38.34 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  38.34 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  38.34 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.45 
 
 
320 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  43.51 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.83 
 
 
623 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  36.77 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.54 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
325 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 
746 aa  81.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.36 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  42.37 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  37.4 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  37.93 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  33.55 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.44 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.03 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  34 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  40.77 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  38.81 
 
 
716 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.92 
 
 
242 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  34.88 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  39.55 
 
 
738 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  34.88 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.14 
 
 
717 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.1 
 
 
713 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
722 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.36 
 
 
722 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  35.21 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  36.75 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.18 
 
 
717 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  37.29 
 
 
716 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  35.37 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  38.98 
 
 
722 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  36.21 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  23.98 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  33.79 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  34.45 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.22 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.48 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  28.51 
 
 
714 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  36.89 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  31.29 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.21 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.63 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  32.54 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.5 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.59 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.98 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  27.38 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  21.98 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  21.98 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  31.03 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.11 
 
 
304 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  31.03 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  36.44 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.82 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  21.98 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  30.66 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  21.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  37.78 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  21.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.82 
 
 
717 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.54 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  30.98 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  21.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  21.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  21.55 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  27.95 
 
 
714 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  30.77 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  32.16 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  29.17 
 
 
267 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.46 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  34.13 
 
 
704 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  29.92 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  35.65 
 
 
714 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.78 
 
 
705 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>