More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3220 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  59.2 
 
 
639 aa  786    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
631 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  54.42 
 
 
631 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
631 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
631 aa  690    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  52.09 
 
 
631 aa  658    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
631 aa  687    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  58.28 
 
 
643 aa  742    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  54.11 
 
 
631 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  54.42 
 
 
631 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  55.35 
 
 
630 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
631 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 
631 aa  688    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  100 
 
 
653 aa  1331    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 
642 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  53.46 
 
 
642 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 
631 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  46.59 
 
 
642 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  48.84 
 
 
613 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  47.06 
 
 
642 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  48.14 
 
 
629 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  46.11 
 
 
642 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  47.38 
 
 
632 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  46.52 
 
 
630 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  46.82 
 
 
632 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  46.18 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  48.77 
 
 
630 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  46.76 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  46.82 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  46.7 
 
 
629 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  47.75 
 
 
631 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  43.67 
 
 
636 aa  553  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  46.39 
 
 
641 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  42.77 
 
 
620 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
627 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  42.28 
 
 
621 aa  517  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  44.24 
 
 
633 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  43.45 
 
 
652 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  42.26 
 
 
620 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  43.67 
 
 
630 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 
622 aa  505  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  41.53 
 
 
634 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
630 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  43.03 
 
 
625 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  43.59 
 
 
626 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
623 aa  497  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  40.65 
 
 
625 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  40.65 
 
 
625 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  40.92 
 
 
641 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  42.84 
 
 
631 aa  488  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  40.67 
 
 
641 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  41.25 
 
 
644 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  40.03 
 
 
622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  43.1 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  38.43 
 
 
642 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  38.05 
 
 
649 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  38.2 
 
 
649 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  37.75 
 
 
661 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  37.75 
 
 
661 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  37.9 
 
 
649 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  37.75 
 
 
688 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  37.96 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
559 aa  415  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 
641 aa  416  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.88 
 
 
636 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 
551 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  38.36 
 
 
663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  37.96 
 
 
651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37 
 
 
626 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  38.2 
 
 
636 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  37.94 
 
 
641 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
551 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.42 
 
 
564 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
559 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
648 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.23 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  39.89 
 
 
723 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.23 
 
 
640 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
555 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
560 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 
560 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 
555 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  37.38 
 
 
633 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  36.62 
 
 
648 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 
551 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.85 
 
 
560 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
632 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
648 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 
558 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
648 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 
561 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
563 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
654 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
660 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
648 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
660 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 
556 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>