More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3016 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 545 aa  1118    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  63.95 
 
 		 550 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 		 541 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  39.82 
 
 		 552 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  42.29 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  39.45 
 
 		 538 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  38.83 
 
 		 533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  37.08 
 
 		 542 aa  349  9e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  37.91 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 		 531 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  37.1 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  33.39 
 
 		 538 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  33.45 
 
 		 544 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 		 530 aa  313  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 		 535 aa  312  7.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  35.12 
 
 		 534 aa  306  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  34.64 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 		 541 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  35.87 
 
 		 558 aa  287  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.33 
 
 		 543 aa  286  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  33.03 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 537 aa  279  9e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 549 aa  279  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.43 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 539 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.88 
 
 		 537 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  34.39 
 
 		 555 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 545 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.94 
 
 		 543 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.45 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.94 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.94 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.94 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.94 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  34.51 
 
 		 559 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.47 
 
 		 525 aa  269  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.27 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  33.4 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  33 
 
 		 539 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  33.02 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  33.02 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  33.02 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  33.02 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  33.02 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  33.02 
 
 		 535 aa  264  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.14 
 
 		 558 aa  263  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 538 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  34.08 
 
 		 554 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  34.14 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.14 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.14 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.14 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  34.14 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.14 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  32.23 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  32.73 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 		 543 aa  261  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.68 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.01 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 558 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  32.86 
 
 		 526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.01 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 525 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 		 526 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.68 
 
 		 536 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.49 
 
 		 536 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  30.88 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 537 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  35.04 
 
 		 532 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  30.3 
 
 		 536 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  30.3 
 
 		 536 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.3 
 
 		 536 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.6 
 
 		 538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  32.06 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>