More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2598 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  49.26 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  32.96 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  32.96 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  33.21 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  31.85 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  31.02 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.07 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  32.12 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  29.58 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  28.1 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.35 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  26.52 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  27.23 
 
 		 212 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  27.2 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  27.44 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  26.84 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.97 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  26.57 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.57 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  24.82 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 132 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  26.76 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  27.08 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.64 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  23 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.76 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  25.53 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  23.83 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  36.46 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  22.5 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  23.99 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  22.78 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32.45 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  22.86 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  25.25 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  30.26 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.48 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  36.04 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 154 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>