241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1975 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
503 aa  982    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.08 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.5 
 
 
519 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.61 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.21 
 
 
536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  46.76 
 
 
515 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.81 
 
 
536 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.65 
 
 
506 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  45.84 
 
 
500 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.95 
 
 
508 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  45.15 
 
 
504 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  50.32 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.59 
 
 
503 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.11 
 
 
502 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  44.14 
 
 
503 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.55 
 
 
504 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  44.81 
 
 
508 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  46.71 
 
 
504 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  43.43 
 
 
504 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  44.36 
 
 
505 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  43.23 
 
 
504 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  43.43 
 
 
504 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  43.43 
 
 
504 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  43.23 
 
 
504 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  47.12 
 
 
500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  44.12 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  47.36 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  44.85 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  45.61 
 
 
505 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  43.14 
 
 
506 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.62 
 
 
502 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  45.18 
 
 
504 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  45.33 
 
 
498 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.2 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  44.72 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.03 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  43.03 
 
 
500 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  43.38 
 
 
504 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  42.54 
 
 
504 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  44.47 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.51 
 
 
501 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  44.58 
 
 
510 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  44.47 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  45.28 
 
 
500 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.47 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  44.01 
 
 
512 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.99 
 
 
500 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  44.47 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  43.84 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  44.47 
 
 
506 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  43.73 
 
 
506 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  43.38 
 
 
504 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  45.13 
 
 
503 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  42.97 
 
 
504 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  43.38 
 
 
504 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  45.51 
 
 
505 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  47.26 
 
 
503 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  46.06 
 
 
504 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  44.24 
 
 
508 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  43.18 
 
 
504 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  41.93 
 
 
508 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.48 
 
 
496 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  44.65 
 
 
500 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.83 
 
 
500 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.81 
 
 
505 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.41 
 
 
500 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  43.38 
 
 
504 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  43.78 
 
 
510 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.44 
 
 
501 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  43.06 
 
 
489 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  43.91 
 
 
499 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  45.97 
 
 
509 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  42.42 
 
 
498 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  43.86 
 
 
500 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  42.32 
 
 
504 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  45.01 
 
 
512 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  42.39 
 
 
506 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  44.14 
 
 
502 aa  389  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.73 
 
 
509 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  43.71 
 
 
500 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  41.48 
 
 
508 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  44.02 
 
 
505 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  41.87 
 
 
508 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.9 
 
 
504 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  43.46 
 
 
501 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.44 
 
 
501 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  43.38 
 
 
505 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  41.82 
 
 
509 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  43.64 
 
 
505 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42.19 
 
 
509 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  42.13 
 
 
504 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44 
 
 
497 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  44.49 
 
 
504 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  45.45 
 
 
502 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  49.39 
 
 
502 aa  382  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  42.12 
 
 
509 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  42.95 
 
 
504 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  42.8 
 
 
500 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  43.09 
 
 
495 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  42.45 
 
 
506 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>