More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1724 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
232 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
231 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2554  cyclic nucleotide-binding protein  30.35 
 
 
225 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531309  normal  0.0738389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2092  cyclic nucleotide-binding protein  31.41 
 
 
223 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.052922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.29 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.18 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0270  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.27 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.57 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.92 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.32 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.62 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  25.47 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.42 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.42 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  25 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
225 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.83 
 
 
224 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.65 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.35 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  25.47 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  25.47 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  25.47 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  24.64 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  23.76 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  25.49 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.1 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.51 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  25.47 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1411  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  26.73 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  24.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.47 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  24.06 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>