More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0773 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1115    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  34.13 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  33.93 
 
 
487 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  33.93 
 
 
487 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  35.46 
 
 
500 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  35.59 
 
 
482 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  35.93 
 
 
658 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.66 
 
 
486 aa  208  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  32.73 
 
 
484 aa  206  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.79 
 
 
492 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  35.53 
 
 
493 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  35.53 
 
 
493 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.54 
 
 
491 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  34.18 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  34.5 
 
 
486 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.62 
 
 
569 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  33.93 
 
 
493 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  33.13 
 
 
498 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.39 
 
 
495 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  32.33 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  35 
 
 
487 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  30.87 
 
 
552 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.18 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  32.21 
 
 
493 aa  170  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  29.43 
 
 
515 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  31.67 
 
 
597 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.59 
 
 
517 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.97 
 
 
563 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.36 
 
 
571 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.97 
 
 
563 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.8 
 
 
563 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  27.3 
 
 
623 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.89 
 
 
534 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.84 
 
 
599 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.52 
 
 
589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  28.99 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  28.99 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.11 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  29.9 
 
 
609 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.73 
 
 
598 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.55 
 
 
550 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  28.15 
 
 
528 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 
502 aa  144  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  26.92 
 
 
530 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.62 
 
 
584 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  28.84 
 
 
529 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  26.94 
 
 
572 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  27.4 
 
 
510 aa  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.85 
 
 
586 aa  143  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.81 
 
 
566 aa  143  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.84 
 
 
550 aa  143  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.48 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.61 
 
 
601 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.07 
 
 
464 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.02 
 
 
491 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.69 
 
 
589 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  27.62 
 
 
512 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.38 
 
 
482 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.78 
 
 
596 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.78 
 
 
587 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  28.6 
 
 
582 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.85 
 
 
557 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.55 
 
 
503 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.64 
 
 
560 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.1 
 
 
533 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.78 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  27.54 
 
 
587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.96 
 
 
598 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  28.47 
 
 
523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.78 
 
 
596 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30 
 
 
591 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  28.43 
 
 
925 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.2 
 
 
603 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1072  flavoprotein  29.01 
 
 
598 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.208394  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  28.5 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.57 
 
 
523 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  28.6 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.41 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.75 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.85 
 
 
485 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.58 
 
 
591 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.13 
 
 
602 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.18 
 
 
597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.52 
 
 
550 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  29.11 
 
 
560 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.72 
 
 
553 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.18 
 
 
596 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.7 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.09 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.02 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.25 
 
 
463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.72 
 
 
510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  28.47 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.67 
 
 
564 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.64 
 
 
593 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.1 
 
 
564 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>