More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0581 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0537  Pyrogallol hydroxytransferase  60.73 
 
 
857 aa  1086    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0581  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
856 aa  1776    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1869  molybdopterin oxidoreductase  69.63 
 
 
857 aa  1293    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3526  molybdopterin oxidoreductase  34.39 
 
 
992 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5286  molybdopterin oxidoreductase  34.03 
 
 
992 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  29.71 
 
 
827 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.36 
 
 
847 aa  292  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  30.52 
 
 
822 aa  290  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  30.52 
 
 
822 aa  289  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  31.08 
 
 
824 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  32.48 
 
 
799 aa  283  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  28.68 
 
 
826 aa  282  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.53 
 
 
792 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.97 
 
 
829 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.97 
 
 
829 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.97 
 
 
829 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  31.16 
 
 
794 aa  271  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  27.53 
 
 
801 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  30.97 
 
 
829 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  30.18 
 
 
820 aa  269  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 
817 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  30.04 
 
 
822 aa  267  8e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.4 
 
 
823 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1389  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  27.8 
 
 
857 aa  266  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  28.83 
 
 
848 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  28.83 
 
 
848 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  28.83 
 
 
848 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  28.83 
 
 
848 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  28.96 
 
 
828 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
816 aa  261  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  28.37 
 
 
848 aa  260  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  28.71 
 
 
848 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.9 
 
 
814 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  28.59 
 
 
848 aa  259  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0362  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
857 aa  258  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.9 
 
 
814 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.88 
 
 
829 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.9 
 
 
814 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.9 
 
 
814 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.9 
 
 
814 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.74 
 
 
829 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  28.59 
 
 
848 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  29.8 
 
 
838 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.74 
 
 
829 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3905  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 
859 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  30.52 
 
 
820 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  28.79 
 
 
828 aa  256  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  28.08 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.1 
 
 
850 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.97 
 
 
850 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.71 
 
 
850 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2333  molybdopterin oxidoreductase  29.21 
 
 
880 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  27.69 
 
 
820 aa  253  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.58 
 
 
850 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.97 
 
 
850 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  28.2 
 
 
777 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  28.93 
 
 
830 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.95 
 
 
814 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  28.89 
 
 
799 aa  253  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.7 
 
 
814 aa  253  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  27.82 
 
 
830 aa  253  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  28.55 
 
 
830 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  27.92 
 
 
825 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  28.21 
 
 
822 aa  251  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  29.16 
 
 
829 aa  251  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  29.62 
 
 
838 aa  250  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  29.6 
 
 
830 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1279  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.12 
 
 
865 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0761617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  27.94 
 
 
777 aa  249  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 
770 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
817 aa  249  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  27.26 
 
 
815 aa  249  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  28.07 
 
 
777 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  27.68 
 
 
759 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  27.68 
 
 
777 aa  248  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  27.68 
 
 
777 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  27.68 
 
 
759 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  27.69 
 
 
830 aa  247  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  27.68 
 
 
768 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.86 
 
 
756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2278  dimethyl sulfoxide reductase precursor  28.2 
 
 
890 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.54 
 
 
772 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  27.43 
 
 
777 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  27.55 
 
 
777 aa  242  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.06 
 
 
799 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4651  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.24 
 
 
809 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0188549  normal  0.28896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.32 
 
 
809 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  27.96 
 
 
816 aa  240  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4560  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.86 
 
 
809 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.949615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  28.12 
 
 
837 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.03 
 
 
820 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.96 
 
 
816 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  28.15 
 
 
813 aa  239  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4651  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.81 
 
 
809 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00741112  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 
753 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>