More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0114 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 329 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  28.53 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  31.55 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  40.28 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  39.78 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  40.58 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 257 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 252 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  32.43 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  27.01 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 143 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  35.05 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  30.19 
 
 		 249 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.63 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  38.57 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  38.57 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  38.57 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  34.78 
 
 		 148 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  39.39 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 147 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.88 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.88 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  37.88 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.02 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  37.88 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.88 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  32.38 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  34.85 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  42.62 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>