293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1245 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  45.79 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  44.65 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  45.25 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  37.84 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  41.18 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  40.85 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  42.86 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  36.21 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  36.8 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  36.21 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  38.01 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  38.01 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  37.61 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.21 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.15 
 
 		 263 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  36.94 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  35.38 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  38.99 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  39.45 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  35.21 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  34.63 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  37.04 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  36.32 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  36.67 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  35.84 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  35.78 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.27 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  38.27 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  35.75 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  42.47 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  35.85 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  33.19 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  41.33 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  37.78 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  36.73 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.84 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  33.18 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  36.49 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  34.45 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  36.5 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  36.7 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  40.54 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  40.29 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  35.78 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  39.88 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  36.68 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  39.31 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  38.53 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  39.31 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  32.51 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.37 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  36.28 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.36 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  38.46 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  38.5 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.05 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  37.16 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  36.54 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  36.54 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.93 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  37.38 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  36.7 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  36.7 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  36.28 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  34.88 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  38.3 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  32.46 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  34.5 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  35.64 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.85 
 
 		 247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  35.05 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  34.5 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  34.96 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  35.8 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  35.84 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.33 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  35.29 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  33.01 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  30.67 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  33.49 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  33.49 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  35.16 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  33.02 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  35.5 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  35.5 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  36.46 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  35.5 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  34.67 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.84 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  35 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  32.31 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  29.95 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  35.23 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  31.05 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  35.56 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.73 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  33.5 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>