More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5435 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  929    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  49.06 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5220  histidine kinase  49.88 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  37.44 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  33.26 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.73 
 
 		 1418 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5175  histidine kinase  35.56 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  26.67 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  25.77 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  30.07 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  23.62 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 978 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0983  histidine kinase  27.51 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  27.36 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1044  histidine kinase  26.39 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.949503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2606  signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0231945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4547  signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 592 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 		 1120 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  25.33 
 
 		 623 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 1156 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  26.15 
 
 		 582 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  25 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  28.24 
 
 		 659 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.88 
 
 		 1362 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  25.56 
 
 		 876 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  25.97 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  27.96 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  26 
 
 		 1323 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.18 
 
 		 1169 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  23.91 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 677 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  25.18 
 
 		 903 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.39 
 
 		 862 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.13 
 
 		 975 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 856 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 1141 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  24.48 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 691 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1159 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.95 
 
 		 1029 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  23.06 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  24.71 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 1029 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  22.01 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  22.96 
 
 		 1361 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  27.21 
 
 		 1157 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  26.35 
 
 		 857 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  26.98 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 1037 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  23.49 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  27.24 
 
 		 1159 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  27.24 
 
 		 1159 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.76 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.54 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  24.83 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  26.64 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1159 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 		 757 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 1158 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 		 1159 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 1022 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 979 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 846 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.68 
 
 		 738 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  25.74 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  25.48 
 
 		 858 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  21.05 
 
 		 810 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  26.91 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 1096 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  25.78 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  25.89 
 
 		 1193 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>