More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  33.76 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  29.64 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  32.95 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  27.91 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  31.83 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  31.51 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  28.52 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  34.32 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  38.1 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  32.8 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  30.45 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  31 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  29.57 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  31.46 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  30.74 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  29.09 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  28.52 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  31.13 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  28.62 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  30.74 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  31.5 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  25.73 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  29.6 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.89 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  36.5 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  27.92 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  31.76 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  30.45 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  27.81 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  28.44 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  30.93 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  28.68 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  29.96 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  31.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  30.22 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  29.58 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  28.16 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  28.57 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  31.1 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  29.54 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  27.56 
 
 		 592 aa  97.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  28.16 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  28.1 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  28.21 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  29.71 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  28.29 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  28.68 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  28.68 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  28.16 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  30.66 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  27.51 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  26.43 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  30.94 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  28.03 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  27.48 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  29.48 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  30.43 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  29.48 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  26.43 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  26.11 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  31.08 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  31.16 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  27.44 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  29.23 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0697  transketoloase, C half  43.43 
 
 		 104 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.837924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  28.96 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  26.27 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  27.1 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  29.85 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  29.84 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  29.85 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  29.23 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  29.63 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.52 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  29.11 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  25.57 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  25.48 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  28.8 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  29.59 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  29.48 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  29.59 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  30.48 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0130  Transketolase central region  24.62 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  32.48 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  27.31 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  28.52 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  30.72 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  27.03 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2780  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.16 
 
 		 646 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.952948  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  25.71 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  26.38 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  26.67 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  26.69 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  28.04 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>