63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3373 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  757    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  47.55 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  36.23 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  37.42 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  36.14 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  33.15 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  38.49 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.48 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.46 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  34.09 
 
 		 348 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  28.7 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.92 
 
 		 897 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  24.88 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  27.19 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.04 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  35.78 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  31.62 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  30.92 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  26.63 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.2 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.1 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0872  hypothetical protein  25.84 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.58 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.68 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1078 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  23.35 
 
 		 1527 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  29.84 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  19.8 
 
 		 1044 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  23.13 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.17 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.89 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.1 
 
 		 1120 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  29.84 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.62 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  23.83 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  29.33 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  23.43 
 
 		 661 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1082 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  29.33 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.27 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  25.82 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  23.77 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  23.33 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25.42 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 630 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.55 
 
 		 652 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 999 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.69 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  28 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  23.32 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  27.35 
 
 		 759 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23.15 
 
 		 1084 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 983 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1063 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  24.43 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  26.98 
 
 		 952 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.44 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>