More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2873 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 419 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  56.16 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  52.54 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  43.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  44.14 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  40.63 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  44.86 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 		 452 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  44.02 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  38.83 
 
 		 428 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 463 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  26.63 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  25.46 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  28.73 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  28.5 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  36.45 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  26.7 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.52 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  22.85 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.69 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  31.33 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  29.8 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.91 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  22.75 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  24.58 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  27.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  25.36 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  24.58 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  24.58 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.36 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  36.56 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  24.58 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  24.58 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1513  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  27.07 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  23.77 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  22.25 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  37.62 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  23.77 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  24.66 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  24.66 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  23.77 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  23.77 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>