More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1513 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1513  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  712    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  39.24 
 
 
349 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 
332 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
347 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
376 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  24.5 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.8 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  25.75 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.51 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  27.2 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.51 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.47 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
389 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  26.89 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.57 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.66 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  24.81 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.21 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.78 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.7 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.07 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.78 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>