43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2828 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  486  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  40.68 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  34.3 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  30.58 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.51 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  26.97 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  29.76 
 
 		 847 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  29 
 
 		 847 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  26.11 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  26.1 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.48 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  25.22 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  26.07 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  25.22 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  24.55 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  23.27 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  23.28 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  30 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  22.61 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  21.58 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  26.18 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  21.93 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  26.45 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  26.25 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  23.12 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  22.51 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  22.01 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  21.47 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  26.48 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  22.16 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  18.81 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  23.94 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  23.48 
 
 		 301 aa  48.5  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  24.32 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  22.59 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  24.12 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  23.86 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  23.88 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  19.15 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  23.53 
 
 		 261 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>