283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2191 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2191  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.36 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.91 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.79 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.43 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  24.42 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  25.35 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1539  two component LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.19 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0897  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.54 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1284  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.21 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.96 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  24.19 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  25.93 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.17 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.9 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3481  two component LuxR family transcriptional regulator  23 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.016753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  25.7 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  25.49 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  21.5 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  24.77 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  23.72 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  26.05 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  23.72 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0474  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.5 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  23.72 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  23.72 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  28.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.98 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  25.12 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2990  two component LuxR family transcriptional regulator  21.96 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5301  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0298564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.58 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.17 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  25.47 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  22.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  22.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  22.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  22.43 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  22.43 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.17 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>