More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1073 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  100 
 
 		 539 aa  1103    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  70.13 
 
 		 529 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  65.08 
 
 		 513 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  66.18 
 
 		 509 aa  655    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  61.11 
 
 		 522 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  54.71 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  54.97 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  55.86 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  54.31 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  54.17 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  51.48 
 
 		 945 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.26 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.09 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.46 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.41 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  46.49 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  44.37 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  43.39 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  46.74 
 
 		 442 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.48 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  44.27 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.46 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  44.47 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.71 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  41.62 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  43.14 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.05 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  45.68 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.95 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  43.65 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.57 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.46 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.27 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.79 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.1 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.94 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.85 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  41.79 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  43.76 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.14 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  41.39 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.42 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  42.29 
 
 		 508 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  43.02 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  39.87 
 
 		 453 aa  365  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  43.24 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  43.02 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42.44 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  40.66 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  43.56 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.46 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  42.79 
 
 		 460 aa  363  6e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  41.5 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  40.18 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  41.65 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  41.39 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  40.74 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.27 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 444 aa  359  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 450 aa  359  9e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  42.7 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  40.18 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  43.9 
 
 		 450 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  40.69 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  39.67 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  40.27 
 
 		 452 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  40.18 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  40 
 
 		 469 aa  355  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  40.31 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.16 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  39.73 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  41.22 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  41.44 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 451 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  43.3 
 
 		 456 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  39.7 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  43.82 
 
 		 445 aa  352  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>