78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0794 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  86.82 
 
 		 440 aa  784    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  914    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  90.89 
 
 		 461 aa  853    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  32.93 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  31.88 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 495 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  29.52 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  27.59 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  27.57 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  24.03 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  19.87 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  23.47 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  20.63 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.36 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  23 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  19.88 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 521 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.81 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>