More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2319 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 739 aa  1487    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  50 
 
 		 711 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  51.67 
 
 		 763 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  48.86 
 
 		 692 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  53.53 
 
 		 610 aa  350  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  55.52 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.64 
 
 		 705 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.73 
 
 		 628 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 		 661 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  48.94 
 
 		 629 aa  277  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 		 607 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  47.18 
 
 		 625 aa  276  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  29.15 
 
 		 685 aa  276  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  42.96 
 
 		 630 aa  273  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  44.5 
 
 		 641 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  45.48 
 
 		 662 aa  273  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 681 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 681 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  44.76 
 
 		 608 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 		 607 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  49.39 
 
 		 633 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  46.32 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  45.33 
 
 		 667 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  45.33 
 
 		 667 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  45.33 
 
 		 667 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  48.96 
 
 		 633 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  28.9 
 
 		 680 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  42.14 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.33 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  45.33 
 
 		 661 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.52 
 
 		 633 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 641 aa  267  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.95 
 
 		 632 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 661 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.95 
 
 		 632 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  50.16 
 
 		 648 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  48.94 
 
 		 635 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 688 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  47.87 
 
 		 634 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  46.65 
 
 		 613 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 687 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  45.27 
 
 		 631 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  48.94 
 
 		 620 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  47.71 
 
 		 611 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  47.32 
 
 		 602 aa  263  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  45.9 
 
 		 615 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  44.21 
 
 		 647 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.19 
 
 		 633 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  41.85 
 
 		 650 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46.99 
 
 		 621 aa  263  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.69 
 
 		 619 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  47.14 
 
 		 645 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  45.09 
 
 		 653 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 622 aa  261  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  48.48 
 
 		 616 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  41.8 
 
 		 614 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  44.91 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 		 631 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  47.8 
 
 		 643 aa  259  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  48.18 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.2 
 
 		 628 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  43.32 
 
 		 594 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  45.99 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  45.24 
 
 		 641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  45.62 
 
 		 644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  45.62 
 
 		 644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.65 
 
 		 626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  44.71 
 
 		 652 aa  255  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  44.41 
 
 		 665 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 		 630 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 		 638 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  44.71 
 
 		 624 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 608 aa  253  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 		 637 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  47.83 
 
 		 660 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 638 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  46.95 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  43.2 
 
 		 575 aa  252  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  44.35 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  43.2 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  46.63 
 
 		 598 aa  251  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  45.32 
 
 		 648 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  42.82 
 
 		 670 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  43.87 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  45.14 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 		 600 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  46.09 
 
 		 657 aa  248  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  46.63 
 
 		 647 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  41.71 
 
 		 681 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  44.85 
 
 		 644 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  45.73 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  44.28 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  46.2 
 
 		 674 aa  247  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>