More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1430 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.11 
 
 
233 aa  387  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0765389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.25 
 
 
237 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.1 
 
 
233 aa  363  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  51.53 
 
 
231 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.32 
 
 
231 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.32 
 
 
231 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0691  amino acid ABC transporter permease  49.34 
 
 
231 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.522451  normal  0.944357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.44 
 
 
231 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0018  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.08 
 
 
237 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.91 
 
 
598 aa  207  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  48.47 
 
 
596 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4190  polar amino acid ABC transporter permease  47.11 
 
 
245 aa  205  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.012386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4164  polar amino acid ABC transporter permease  47.11 
 
 
245 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4238  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 
245 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4214  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.3 
 
 
247 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.76 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.76 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4526  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.29 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.58 
 
 
596 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.05 
 
 
231 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.501916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0892  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
232 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.16 
 
 
596 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2915  glutamine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
233 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4005  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
246 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.89 
 
 
240 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1138  amino acid ABC transporter permease  48.36 
 
 
240 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1618  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.36 
 
 
240 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36220  putative amino acid permease  45.85 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0769892  hitchhiker  0.00221047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4763  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 
240 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3087  putative amino acid permease  46.29 
 
 
238 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1620  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 
240 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0497895  normal  0.121241 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0838  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  45.75 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.751563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0323  general L-amino acid transport system permease protein aapQ  45.75 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0738317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2053  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  45.75 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1898  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  45.75 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1885  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  45.75 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1667  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  45.75 
 
 
320 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1516  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.89 
 
 
240 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2587  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1594  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.83 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.385392  normal  0.549432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213094  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6369  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2449  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  46.01 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3909  amino acid ABC transporter permease  41.85 
 
 
248 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4172  amino acid ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 
248 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1547  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.72 
 
 
246 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.090707  normal  0.921266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
217 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
240 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4544  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
240 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424386  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_003296  RS05399  amino acid ABC transporter transmembrane protein  40.38 
 
 
233 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.66216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4044  ABC transporter permease  40.53 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9240  ABC transporter membrane spanning protein  38.28 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46920  putative permease of ABC transporter  39.65 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0128  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.06 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4330  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
240 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
240 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57318  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  39.19 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
240 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0400  amino acid ABC transporter permease  38.66 
 
 
242 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.123104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.62 
 
 
216 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.97 
 
 
248 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.97 
 
 
248 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.619698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  38.29 
 
 
242 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1070  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  40.53 
 
 
248 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.988617 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4371  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 
243 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2256  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 
240 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0358  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
242 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0871077  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4536  amino acid ABC transporter permease  39.65 
 
 
248 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.193681  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
242 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3430  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0349  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0597857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3433  glutamate/aspartate transport system permease protein  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2621  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1210  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3395  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  40 
 
 
246 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
216 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2211  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
245 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0591  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273036  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1099  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
248 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3756  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1226  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07310  Amino acid ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.955107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2088  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2713  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
246 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1632  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
248 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0304  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltJ  37.44 
 
 
248 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0565  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
246 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0187  amino acid ABC transporter permease  38.7 
 
 
246 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
246 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0637  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
246 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.71 
 
 
221 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0335  amino acid ABC transporter permease  37 
 
 
248 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2572  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0188674 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.54 
 
 
245 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0681  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.17 
 
 
248 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
218 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3361  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
246 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0235046  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
337 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>