53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2766 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  100 
 
 		 366 aa  742    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  79.51 
 
 		 366 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  71.87 
 
 		 368 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  70.11 
 
 		 368 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  57.46 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  57.46 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  57.18 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  51.91 
 
 		 865 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  41.3 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.44 
 
 		 567 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  37.64 
 
 		 746 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  40.9 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  40.07 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  33.6 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  36.53 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  34.96 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  32.33 
 
 		 627 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 730 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  31.86 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  31.86 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  34.12 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  30.73 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.84 
 
 		 644 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  33.87 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  35.37 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  31.34 
 
 		 686 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  31.96 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  32.79 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  32.94 
 
 		 666 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  29.92 
 
 		 571 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  31.52 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.14 
 
 		 794 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.04 
 
 		 487 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  28.23 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  33.47 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  28.7 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  29.82 
 
 		 1081 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  25.59 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  28.1 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  26.77 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  26.32 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  31.09 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  26.19 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  29.41 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  29.41 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  28.57 
 
 		 427 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>