285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2648 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  65.24 
 
 
513 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  65.45 
 
 
513 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
500 aa  1004    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  67.28 
 
 
507 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  87.45 
 
 
523 aa  852    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  68.15 
 
 
510 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  67.14 
 
 
510 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  65.22 
 
 
507 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  50.51 
 
 
495 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  52.23 
 
 
549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.07 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  51.12 
 
 
495 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.87 
 
 
497 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.87 
 
 
497 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.39 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.95 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  50.3 
 
 
497 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.29 
 
 
497 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.21 
 
 
549 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  50.21 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  41.12 
 
 
516 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  41.74 
 
 
511 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
507 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  39.63 
 
 
508 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  42.47 
 
 
509 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.74 
 
 
514 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 
506 aa  352  7e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  43.32 
 
 
520 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
506 aa  352  8.999999999999999e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
499 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  40.53 
 
 
511 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  38.68 
 
 
498 aa  345  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 
497 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
514 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 
505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 
505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 
505 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  40.8 
 
 
510 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  41.12 
 
 
524 aa  336  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  37.32 
 
 
505 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
526 aa  335  7.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.65 
 
 
508 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  38.6 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 
505 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 
506 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
510 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
512 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  42.08 
 
 
534 aa  334  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 
513 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
507 aa  332  8e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  36.9 
 
 
505 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
518 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 
510 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  40.29 
 
 
510 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  40.29 
 
 
513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.15 
 
 
506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 
513 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 
510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  43.42 
 
 
509 aa  326  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 
510 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  39.3 
 
 
514 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
506 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
506 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 
511 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39.19 
 
 
507 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 
511 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
515 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
506 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.96 
 
 
515 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
506 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  40.69 
 
 
506 aa  322  7e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  40.41 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  40.46 
 
 
504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  39.67 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  41.42 
 
 
514 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 
514 aa  320  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.76 
 
 
508 aa  319  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
522 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
515 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 
517 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
514 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 
512 aa  317  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  39.13 
 
 
519 aa  317  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  39.6 
 
 
537 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  36.38 
 
 
489 aa  315  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>