More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1763 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  68.86 
 
 		 531 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 536 aa  1087    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  53.44 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  45.9 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  46.72 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 		 521 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  44.55 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  44.55 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 		 522 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 531 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 529 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 		 532 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 532 aa  324  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 		 529 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.02 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 		 546 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 518 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.29 
 
 		 550 aa  316  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  37.18 
 
 		 533 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 564 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.79 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  37.25 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  37.25 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  37.25 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  37.25 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  37.25 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  37.06 
 
 		 530 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  34.23 
 
 		 547 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  37.52 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 529 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 		 547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 533 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  35.53 
 
 		 538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.83 
 
 		 563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 533 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.33 
 
 		 533 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  34.72 
 
 		 535 aa  287  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.52 
 
 		 535 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 531 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  30.1 
 
 		 531 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 		 523 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 536 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 538 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.17 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 538 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 536 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 536 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 528 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.15 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 516 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 515 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.89 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.89 
 
 		 516 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.69 
 
 		 516 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.69 
 
 		 516 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.69 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 521 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  24.03 
 
 		 523 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  25.51 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>