139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0802 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.94 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.09 
 
 
216 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 
229 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  41.85 
 
 
210 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  41.4 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.53 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.9 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.97 
 
 
207 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.78 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.41 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.33 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  41.94 
 
 
148 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.7 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.58 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  31.22 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  32.11 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.89 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.09 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.4 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  28.89 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.22 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.65 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  25.27 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.13 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.12 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.69 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  28.09 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.4 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.87 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.83 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.7 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.2 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.07 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.32 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.3 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.93 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.37 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.28 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  30.53 
 
 
191 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.6 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.26 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  23.64 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.65 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.27 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.82 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.53 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.24 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.09 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  23.53 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.61 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.92 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  27.32 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.97 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  23.67 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  29.2 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  26.96 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  27.78 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.45 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.07 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.55 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.23 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.37 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.35 
 
 
208 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  26.09 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.37 
 
 
197 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.13 
 
 
214 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  23.4 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  26.92 
 
 
249 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.77 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.52 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.23 
 
 
191 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.47 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.39 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001606  putative two-component response regulatory protein  36.92 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.62 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  44 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
198 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  23.64 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.17 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.26 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.27 
 
 
427 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  24.17 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  25.64 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  25.64 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.93 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>