More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3255 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
350 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  65.23 
 
 
353 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  62.14 
 
 
352 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  56.83 
 
 
370 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  53.94 
 
 
331 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  48.47 
 
 
363 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  42.57 
 
 
345 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  38.87 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  38.92 
 
 
357 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  36.44 
 
 
374 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  36.83 
 
 
360 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  36.83 
 
 
360 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  38.94 
 
 
337 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
366 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  34.94 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  37.42 
 
 
326 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  34.56 
 
 
350 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
359 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 
341 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  34.6 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.21 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
338 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  34.66 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 
412 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 
387 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
356 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  40.39 
 
 
335 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
356 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
355 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
333 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
349 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
371 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
388 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
361 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
358 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
339 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.44 
 
 
339 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
365 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
365 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.93 
 
 
343 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.07 
 
 
404 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
334 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
357 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
340 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
353 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
364 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
376 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
368 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
367 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
347 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  30.51 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 
366 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
355 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  29.7 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  26.86 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  32.2 
 
 
341 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
344 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.27 
 
 
438 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
353 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.21 
 
 
357 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 
331 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
333 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
358 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
364 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
361 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
388 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
345 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
337 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.35 
 
 
390 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
327 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
383 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
355 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 
359 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
389 aa  99.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>