42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2225 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  551  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  37.3 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  38.14 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  36.56 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  32.66 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  29.67 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  28.24 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.81 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  33.86 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  34.04 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  30.93 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  31.37 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  27.54 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  27.39 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.39 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.57 
 
 		 1051 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  31.75 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  28.11 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  29.41 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1083 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  27.89 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  25.34 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  31.42 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  24.57 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  26.46 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.6 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  21.97 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  21.97 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  21.98 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  21.89 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  21.29 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  22.22 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  21.46 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  20.59 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  23.43 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  17.08 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>