78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1972 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1972  ABC-type sugar transport system, ATPase component  100 
 
 		 327 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4292  hypothetical protein  37.15 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000159214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0240  hypothetical protein  35.58 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0655032  unclonable  0.00000986847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2622  hypothetical protein  36.47 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.161773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0185  hypothetical protein  35.19 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  hitchhiker  0.00158714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2242  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.58 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.883612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1017  hypothetical protein  35.22 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0226  hypothetical protein  34.87 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  unclonable  0.0000000000368394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4029  hypothetical protein  35.17 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0226  hypothetical protein  35.98 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465216  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0226  hypothetical protein  35.86 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276636  unclonable  0.0000000000664579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0223  hypothetical protein  35.99 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.016326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0180  hypothetical protein  28.94 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.04 
 
 		 775 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  28.62 
 
 		 544 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 917 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1140  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  26.14 
 
 		 794 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  27.39 
 
 		 988 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  28.31 
 
 		 835 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3021  hypothetical protein  28.48 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 793 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  28.66 
 
 		 581 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1244  hypothetical protein  27.59 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1141  hypothetical protein  25.17 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1050 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  25.4 
 
 		 758 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 1151 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  31.07 
 
 		 1063 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 		 862 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2568  hypothetical protein  27.1 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 		 1054 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 1246 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  26.43 
 
 		 1041 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.74 
 
 		 1121 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  24.5 
 
 		 882 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2313  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.01 
 
 		 981 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.762814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 1019 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.36 
 
 		 1191 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1583  hypothetical protein  32.75 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  24.92 
 
 		 728 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  24.67 
 
 		 757 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 802 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.13 
 
 		 856 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.39 
 
 		 916 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 962 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  25.66 
 
 		 580 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 833 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1057  hypothetical protein  23.4 
 
 		 725 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 1101 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.23 
 
 		 1140 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.15 
 
 		 954 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  23.29 
 
 		 779 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1049 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  25.96 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2569  hypothetical protein  25.97 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.92 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  22.01 
 
 		 617 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  23.79 
 
 		 867 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 		 1309 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  22.5 
 
 		 774 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.13 
 
 		 918 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  24.45 
 
 		 785 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.82 
 
 		 822 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  27.08 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 685 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 1154 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 1039 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  24.7 
 
 		 947 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2290  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.56 
 
 		 975 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 748 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  23.94 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  21.07 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  22.49 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  21.59 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.75 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>