More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0675 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  44.72 
 
 
201 aa  167  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 
213 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 
201 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 
229 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  43.94 
 
 
190 aa  151  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 
202 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 
209 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  47.92 
 
 
199 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
213 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
197 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  44.16 
 
 
213 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
202 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
202 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 
192 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 
191 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  38.34 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
196 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 
192 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
192 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
186 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
193 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
199 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
192 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 
191 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
193 aa  134  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.58 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 
202 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
206 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
195 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 
213 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  39.5 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 
206 aa  130  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  38.69 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  45.57 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  43.21 
 
 
179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  34.67 
 
 
219 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 
185 aa  127  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  44.85 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  36.82 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  36.18 
 
 
189 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
185 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
196 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 
196 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  38.76 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  43.15 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  36.18 
 
 
189 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
225 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
198 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
194 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 
225 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.03 
 
 
199 aa  124  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0987  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
194 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
187 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
207 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 
193 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.34 
 
 
214 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 
183 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 
203 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
210 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  46.67 
 
 
235 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>