68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1278 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  100 
 
 		 695 aa  1385    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1390  metallophosphoesterase  53.67 
 
 		 324 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.132933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  52.04 
 
 		 330 aa  273  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1813  metallophosphoesterase  45.35 
 
 		 261 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00110244  normal  0.670349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0945  metallophosphoesterase  37.24 
 
 		 330 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1092  hypothetical protein  36.67 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000751999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  41.92 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  37.02 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  31.4 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  36.47 
 
 		 445 aa  88.6  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1748  hypothetical protein  37.08 
 
 		 222 aa  88.6  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000301419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  34.53 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  32.88 
 
 		 644 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  44.93 
 
 		 572 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 375 aa  52.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  31.97 
 
 		 384 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 415 aa  51.2  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.54 
 
 		 374 aa  50.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  38.37 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  35.56 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 270 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6289  hypothetical protein  27.39 
 
 		 330 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0125254  normal  0.570612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 371 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  30.77 
 
 		 648 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 429 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  26.21 
 
 		 428 aa  48.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.46 
 
 		 924 aa  47.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  27.68 
 
 		 386 aa  47.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 		 1194 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  31.91 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  48.44 
 
 		 758 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  32.58 
 
 		 386 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  48.78 
 
 		 935 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.22 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.94 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.73 
 
 		 379 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  44.44 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  33.64 
 
 		 395 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08610  predicted phosphohydrolase  35.71 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  25.38 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  32.43 
 
 		 912 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  27.69 
 
 		 895 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  33.73 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  29.06 
 
 		 434 aa  45.8  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  36.36 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  32 
 
 		 864 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  46.81 
 
 		 1191 aa  45.8  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  50 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  41.1 
 
 		 1021 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.47 
 
 		 399 aa  45.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 398 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  46.38 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  34.83 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  44.64 
 
 		 553 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  36.25 
 
 		 1153 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  30 
 
 		 390 aa  44.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  32.5 
 
 		 404 aa  44.3  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  40.3 
 
 		 531 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  32.05 
 
 		 858 aa  44.3  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  27.52 
 
 		 528 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  38.75 
 
 		 386 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  34.09 
 
 		 386 aa  43.9  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  39.62 
 
 		 1217 aa  43.9  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  44.64 
 
 		 553 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.48 
 
 		 457 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>