12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1393 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1092  hypothetical protein  47.45 
 
 
225 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000751999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1748  hypothetical protein  44.29 
 
 
222 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000301419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  39.38 
 
 
695 aa  99  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  31.09 
 
 
864 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 
1178 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.83 
 
 
1019 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 
1179 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 
548 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  26.47 
 
 
351 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 
1185 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  26.8 
 
 
993 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>