38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1748 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1748  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000301419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  44.29 
 
 
213 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1092  hypothetical protein  39.8 
 
 
225 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000751999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  32.91 
 
 
695 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 
551 aa  59.7  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.88 
 
 
804 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  37.5 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  26.23 
 
 
550 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  35 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 
550 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.85 
 
 
548 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  35 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  41.82 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  41.82 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  41.82 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  39.34 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  27.81 
 
 
578 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  36.36 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  27.01 
 
 
560 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  27.34 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  37.5 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  37.31 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  33.33 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  26.09 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.79 
 
 
583 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  30.56 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 
556 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  25.81 
 
 
242 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  40 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  25.93 
 
 
225 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  30.59 
 
 
557 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  35.71 
 
 
247 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  27.81 
 
 
569 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  32.73 
 
 
232 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  24.54 
 
 
554 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>