29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1092 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000751999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  47.45 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1748  hypothetical protein  39.8 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000301419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  35.15 
 
 		 695 aa  92.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  28.25 
 
 		 561 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  29.12 
 
 		 864 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  25.62 
 
 		 552 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  34.57 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 993 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 993 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 993 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  26.86 
 
 		 532 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  26.18 
 
 		 586 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 		 1019 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  26.18 
 
 		 586 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 		 1177 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  33.96 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  32 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  34.62 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  22.18 
 
 		 1036 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  26.67 
 
 		 293 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 		 1184 aa  42.4  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  29.03 
 
 		 891 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  25.87 
 
 		 562 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  34.62 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  20.25 
 
 		 924 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  31.33 
 
 		 1319 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  27.56 
 
 		 565 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  34.41 
 
 		 802 aa  41.6  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>