More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3308 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  100 
 
 
845 aa  1735    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  52.83 
 
 
855 aa  840    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
829 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2193  diguanylate cyclase  42.3 
 
 
1196 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.12 
 
 
651 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
633 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.44 
 
 
631 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
835 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
791 aa  217  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.72 
 
 
651 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.59 
 
 
1479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.97 
 
 
918 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
667 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.53 
 
 
661 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
977 aa  210  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.2 
 
 
853 aa  210  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.36 
 
 
645 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
919 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
917 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
631 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
595 aa  209  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  41.06 
 
 
810 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
1964 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  39.8 
 
 
1297 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.34 
 
 
1014 aa  207  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
1029 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
1271 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.54 
 
 
713 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
631 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
891 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.68 
 
 
925 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.93 
 
 
1201 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
975 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
643 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 
738 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 
940 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  41.61 
 
 
823 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
863 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  36.41 
 
 
998 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1853 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
643 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
643 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.65 
 
 
906 aa  205  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.86 
 
 
927 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  38.48 
 
 
1001 aa  204  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1843 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 
643 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
916 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 
1313 aa  204  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.76 
 
 
570 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.21 
 
 
925 aa  204  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
917 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
1240 aa  203  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.78 
 
 
932 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.64 
 
 
592 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 
1145 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
833 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.32 
 
 
923 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
1303 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  45.61 
 
 
589 aa  203  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
868 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 
708 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
977 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1847 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  37.87 
 
 
917 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.75 
 
 
620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
1406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
573 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1400 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
969 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.78 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  39.94 
 
 
905 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.19 
 
 
1075 aa  202  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  35.91 
 
 
828 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
704 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  44.77 
 
 
882 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.78 
 
 
932 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.81 
 
 
1442 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.57 
 
 
858 aa  201  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.2 
 
 
918 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
782 aa  201  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
1954 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 
1069 aa  201  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
919 aa  201  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.83 
 
 
941 aa  201  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>