More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5442 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5442  amidase  100 
 
 		 493 aa  980    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  68.61 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  67.1 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  71.37 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  71.37 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  55.79 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  55.72 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  55.12 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  63.52 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  53.9 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  61.64 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  56.8 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  54.47 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  51.95 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  51.41 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  53.55 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  53.78 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  53.78 
 
 		 464 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  53.78 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  52.6 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  53.56 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  53.56 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  51.96 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  53.35 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  53.35 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  43.58 
 
 		 477 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  40.04 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  39.06 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  39.74 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  39.19 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  38.28 
 
 		 469 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  41.09 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.82 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  38.11 
 
 		 474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  41.37 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  35.33 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  38.04 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  43.08 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  40.31 
 
 		 504 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  37.58 
 
 		 470 aa  216  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  38.53 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  37.33 
 
 		 471 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  36.46 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.41 
 
 		 477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.92 
 
 		 472 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  38.84 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  37.22 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  36.98 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  37.44 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.48 
 
 		 485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  37.05 
 
 		 471 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.22 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.96 
 
 		 485 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  37.36 
 
 		 469 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.18 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.19 
 
 		 475 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.16 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.62 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.3 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.6 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35.56 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.46 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.92 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  33.19 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 		 485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  36.42 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.94 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.13 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.25 
 
 		 477 aa  183  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.98 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.14 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  33.76 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  32.79 
 
 		 495 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.42 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  32.64 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.75 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.05 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.85 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.59 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.85 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.56 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.19 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.14 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  32.3 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  32.3 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  32.3 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  32.3 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  32.48 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0177  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.33 
 
 		 471 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.979626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.69 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  32.3 
 
 		 497 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.4 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.53 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.19 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  32.24 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.26 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.64 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.71 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>