More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0324 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  902    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  40.41 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.5 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.5 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  35.5 
 
 		 402 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  35.28 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  35.97 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  35.97 
 
 		 402 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 514 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 515 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 558 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  48.13 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  27.34 
 
 		 480 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.84 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.1 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.1 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 558 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 519 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.34 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 491 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.1 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 474 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 		 559 aa  149  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.02 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  47.59 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 		 490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 493 aa  146  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 479 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 475 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 474 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 474 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 510 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 		 473 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.23 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.72 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.4 
 
 		 503 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.98 
 
 		 579 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  29.55 
 
 		 474 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.09 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 474 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  30.32 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  26.96 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  25.76 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.76 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
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NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  25.32 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.76 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.58 
 
 		 635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.07 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.7 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.32 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  25.76 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
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